金启倧出身于小吏，任经历官，主持奖赏功劳的事务，勤奋聪敏，有志向节操。孙承宗器重他，任用为通判，查核兵马钱粮，监督修城工程，处理军民诉讼，大得人心。

1625年（明天启五年、后金天命十年）十月，明廷派高第取代孙承宗。高第认为关外肯定守不住，下令将锦州、右屯等城的防御器械全部撤除，把守军全部移回关内。督屯通判金启倧表示反对，上书宁前道袁崇焕说：“锦州、右屯、大凌三个城池都是前锋要地。如果收兵退出，已经安定的百姓又迁徙，已得到的疆界再次沦陷，关内外能经得起几次退守啊！（锦、右、大凌三城皆前锋要地。倘收兵退，既安之民庶复播迁，已得之封疆再沦没，关内外堪几次退守耶！）”袁崇焕也力争不可。但高第态度坚决，最终撤除了锦州、右屯、大小凌河及松山、杏山、塔山的防御器械，袁崇焕、金启倧等一小部分明军留守在宁远城。