2006年08月02日，一个热带扰动在日本远海的北回归线附近生成，03日，联合台风警报中心开始对其发报，04日02时，日本气象厅认定其已发展成为热带低气压并开始发出警报。06日02时，视其快速增强，日本气象厅率先将其升格为热带风暴并将其命名为“玛莉亚”，同时联合台风警报中心将其升格为热带低压并给予编号09W，08时又升格为热带风暴。14时，中央气象台才升格为热带风暴。视其快速增强，并且已有卷眼迹象，07日14时，中央气象台和日本气象厅同时升格其为强热带风暴。20时中央气象台进一步将其升格为台风。次日02时，日本气象厅也将其升格为台风。07日，08时，玛莉亚达到巅峰强度，并于当日发生转向由西北转向东北，进入干空气控制的海域，并逐渐减弱。视其对流衰弱，08日14时，中央气象台将其降格为强热带风暴，20时，日本气象厅将其降格为强热带风暴。台风紧贴着日本海岸线向东北行进，但并未登陆。09日14时，中央气象台和日本气象厅都将其降格为热带风暴。20时，联合台风警报中心将其降格为热带低压。10日02时，联合台风警报中心认为其已经转化为一个温带气旋。10日08时，中央气象台认定其已经转温，并对其停止编号。日本气象厅亦认为其已变性为温带气旋。11日02时，联合台风警报中心认为其已经消散，并停止编号。13日08时，中央气象台认为其已经消散。直到14日14时，日本气象厅才认为其已经消散。