清代以前，台湾和澎湖均隶属于福建行政管辖。1683年清政府统一台湾后，曾设置台湾府，隶属福建巡抚。光绪元年（1875），沈葆桢曾建议将福建巡抚移往台湾，但清政府并未接受，只命令福建巡抚半年驻台，半年仍驻府城(福建)。中法战争后，清政府认识到台湾地位的重要性，开始筹办建省事宜。光绪十一年（1885年），左宗棠上疏请设台湾巡抚，在台湾建立独立行省。经清政府廷议，获得批准。同年10月12日，清政府正式建立台湾省，刘铭传为首任台湾巡抚。其时，台湾省下设3府（台北府、台湾府、台南府），11县（宜兰、淡水、新竹、苗栗、台湾、彰化、云林、嘉义、安平、凤山、恒春），4厅（基隆、南雅、埔里社、澎湖），以及1直隶州（台东）。台湾府辖台湾、彰化、云林、苗栗4县和埔里社厅；原台湾府改为台南府，辖安平（原台湾县）、嘉义（原诸罗县）、凤山、恒春四县和澎湖厅；台北府辖淡水、新竹、宜兰3县和基隆厅、南雅厅。台东直隶州，由原卑南厅升置，辖花莲港厅。从光绪十一年至二十年，台湾省逐渐建立起3府、1州、10县、4厅的行政区划。台湾省光复　光绪二十一年，中国在甲午战争中战败，被迫将台湾及澎湖列岛割让给日本。在日本殖民统治时期，台湾省被废置，改划分为5州3厅（台北州、新竹州、台中州、台南州、高雄州、花莲港厅、台东厅、澎湖厅）。1945年日本战败投降，台湾重新回到祖国的怀抱。1945年8月31日，中国政府颁布《台湾省行政长官公署组织大纲》；9月1日，台湾省行政长官公署在重庆成立临时办公处；9月20日，正式公布《台湾省行政长官公署组织条例》；10月25日，台湾省行政长官公署开始在台湾运作。1947年4月22日，中国政府决议撤销台湾省行政长官公署，改组为台湾省政府。