内源性激活指血液中存在有能使纤溶酶原激活的活化因子，它可能来自静脉或微静脉的内皮细胞，其活性在上肢静脉较之下肢静脉高，这是下肢静脉血栓比上肢静脉多的原因之一。此外在血液中还存在一种活化因子原，当机体的凝血反应一旦被启动，激活的凝血因子之一--凝血因子Ⅺ除参与自身的凝血系统外，也同时激活了此活化因子原。