全集装箱船舱内设有固定式或活动式的格栅结构，舱盖上和甲板上设置固定集装箱的系紧装置， 便于集装箱左翼及定位的船舶。 它与一般杂货船不同，其货舱内有格栅式货架，装有垂直导轨，便于集装箱沿导轨放下，四角有格栅制约，可防倾倒。集装箱船的舱内可堆放三至九层集装箱，甲板上还可堆放三至四层。它与部分集装箱船不同，它是所有舱位用来装运集装箱。